Osmanlı Devleti'nde modernleşme hareketi neticesinde Avrupa tarzında bir üniversite Darülfünun adıyla 1845 yılında kuruldu. 1900 yılana kadar üç kez fasılalarla açılıp kapanan üniversite, bu tarihten itibaren eğitimine aralıksız devam etti. 1900 senesinde aynı zamanda İlahiyat Fakültesi (Ulum-ı Şeriye) bölümü de hizmete girdi. İstanbul Üniversitesi'nin ikinci kez yeniden yapılandırılması döneminde akademik ve bilimsel özgürlüğün geliştirilmesi amacıyla fakülte ve meclisleri de yeniden düzenlendi. Bu kapsamda İlahiyat Fakültesi Meclisi de 24 Aralık 1911 senesinde çalışmalarına başladı. Bilindiği kadarıyla bu meclis ve bu meclise ait zabıtlar, Türk yüksek öğretiminde bu kapsamdaki ikinci örneği teşkil etmektedir.